Un des inconvénients du peroxyde d’hydrogène est cependant que son pouvoir de désinfection baisse assez rapidement.
Le peroxyde d’hydrogène est une forme liquide d'oxygène actif. Ce produit de traitement de l'eau permet de lutter très rapidement et de façon efficace contre les impuretés et les algues (effet immédiat sur les micro-organismes et les spores d’algues). Il propose une alternative au chlore choc mais peut aussi être utilisé en traitement régulier, particulièrement en complément d'un traitement au désinfectant PHMB (ou PolyHexaMéthylène Biguanide)